- Канцелярия
- Бухгалтерская служба
- Отдел правового и кадрового обеспечения
- Планово–экономический отдел
- Служба развития информационных технологий
- Отдел развития программного обеспечения службы развития информационных технологий
- Отдел подготовки информации службы развития информационных технологий
- Отдел развития телемедицины и интернет-ресурсов службы внедрения информационных технологий
- Отдел инноваций и программ в здравоохранении службы развития информационных технологий
- Служба внедрения информационных технологий
- Отдел разработки документации и обработки данных службы внедрения информационных технологий
- Отдел нормативно-справочной информации и интеграции службы внедрения информационных технологий
- Отдел технической поддержки и внедрения программного обеспечения
- Отдел организации проектной деятельности службы внедрения информационных технологий
- Отдел "Контакт-центр" службы внедрения информационных технологий
- Отдел администрирования и технического обслуживания (АиТО)
- Отдел развития региональной медицинской сети
- Отдел защиты информации
- Областная научная медицинская библиотека
- Отдел интеграции и координации платных услуг
- Отдел медицинской статистической информации
- Отдел закупок
- Издательский отдел
- Информационно–координационный отдел
- Отдел сбора и обработки информации по кадровым ресурсам
- Отдел сбора и обработки финансово-экономической информации системы здравоохранения
- Отдел сбора и обработки информации о медицинской деятельности
- Хозяйственная служба